变频器运行时，在输入输出回路中产生的电压电流谐波，通过（电）导纳和辐射的形式干扰邻近弱电系统和连接与同一个电网藕接点的电气设备，严重时会使这些系统和电气设备不能正常运行。这种不良效应在大容量的变频器和无独立变压器的变频器中尤为突出。使邻近无线电设备或通讯系统受到干扰，用变频器传动电动机时，从变频器主回路电缆辐射出的高频干扰，对IOHMZ以下的频带影响较大：船用电话电缆若靠近变频器主回路电缆敷设时，往往伴有杂音出现。使受馈的直流电动机之类的直流负载产生附加发热、噪音或换向恶化。使位于近处或接于同一电网祸接点的控制设备失控和造成继电保护装置线圈发热和特性变化发生误动作。使改善功率因数的补偿电容器发生并联谐振，产生大电流，导致电容器过热和绝缘击穿。
对计算机和监测控制系统等电子设备造成感应干扰，尤其是对机舱内大量的420Am、TP10O等传感器的干扰，使传感器接入的报誓装置指示不准确或发生误动作，严重时能使机舱自动化控制系统瘫痪。当交流侧出现直流分量时（例如在双拍电路中沿变压器绕组两个方向的电流不对称时），使变流变压器出现直流磁化分量和中线过载。因电缆的分布电容对谐波有放大作用，使电缆和船壳的电容过大，造成电缆过电压局部放电，使电缆温度升高，绝缘损坏。
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