工业自动控制系统中经常有如晶闸管可控整流装置和变频调速装置等高电磁干扰源，对系统产生干扰问题，因此防干扰的设计是PLC必须考虑的，一般有隔离、屏蔽和布线三种方式。
通常高频干扰主要来自于分布电容耦合，因此可以通过加装1∶1超隔离变压器的方法来实现，其中性点经电容后与地连接。屏蔽措施可以用金属外壳实现屏蔽，即把PLC系统安装在金属柜中。该金属柜的外壳接地，可以很好的屏蔽静电和磁场，防止空间辐射的干扰。
强弱动力线路应分开走线，且两者间要有一定距离的间隔。开关量与模仿量也要分开敷设，模仿量信号应采用双绞屏蔽电缆方式，屏蔽层一端接地。交流输出线和直流输出线不要用同一根电缆。
模块化程序：将一个整体的控制目标程序拆分成多个小程序模块，它们具有各自的子任务，并对其分别编写后进行调试，最后再把这些小程序模块组合成一个完整的程序。
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