辅助继电器是可编程控制器内部具有的继电器，这种继电器有别于输入、输出继电器，它不能获取外部的输入，也不能直接驱动外部负载，只在程序中使用，起逻辑变换和逻辑记忆作用。
在FX2N型PLC中除输入继电器和输出继电器的元件号采用八进制外，其他元件号均采用十进制，如：M6、M7、M8、M9、M8000等。辅助继电器有通用辅助继电器、断电保持辅助继电器和特殊辅助继电器。
1）通用辅助继电器
通用辅助继电器的元件编号为M0～M499，共500点。它和普通的中间继电器功能一样，运行时如果通用辅助继电器线圈得电，当电源突然中断时线圈失电，其触点立刻恢复为失电状态。
2）断电保持辅助继电器
断电保持辅助继电器的元件编号为M500～M3071，当电源突然中断时线圈失电，但其触点仍能保持断电前的状态。其中M500～M1023共524点，可通过参数设定将其改为通用辅助继电器。M500～M3071共2048点，为专用断电保持辅助继电器。
3）特殊辅助继电器
特殊辅助继电器的元件编号为M8000 ～M8255，共有256点。特殊辅助继电器可用来表示PLC的某些状态、提供时钟脉冲和标志（如进位、错位标志等）、设定PLC的运行方式、步进顺控、禁止中断、设定计数器的计数方式等。但其中有些编号元件没有定义则不能使用。
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