工控机的通用拓展性决定了其在运行周期内，很可能不断地增加软、硬件，以实现扩展功能，特别是具有工程师属性的工控机不可避免地多次更新用户程序。
使用GHOST方法只能恢复到制作GHOST镜像时工控机的状态，若镜像制作之后工控机有软、硬件的变动，则必须通过补充安装补救，但会消耗大量的人力、时间而事倍功半。因此，如要选择使用GHOST方法维护工控机，必须在软、硬件变更后及时制作GHOST镜像备份。
如果工控机有工程师站属性，必须使用户程序与控制站运行程序的时间版本相符，否则将导致无法实现对控制站程序修改的情况再现，而只能通过格式化控制站重新装载用户程序解决。因此，保证GHOST镜像的实时更新是该方法的要点。
GHOST进行数据保存使用GHOST制作镜像时，如果操作不慎，可能覆盖欲保存工控机的目标硬盘，有丢失全部宝贵数据的极大风险。因此，操作时必须慎之又慎，初用者最好在其他计算机上多次练习。
